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Quel logiciel pour cabinet médical choisir ? Le guide simple et pratique

26 juin, 2025

Professionnel de santé, vous devez vous adapter à vos patients et donc naturellement à votre époque. Impossible (ou presque) en 2025 de vouloir gérer votre cabinet médical comme autrefois. Il vous faut désormais être familier des feuilles de soins électroniques (FSE) et vous ne serez pas, comme vos aînés, confrontés aux innombrables documents papier à conserver, trier, archiver. Oublié le temps de l’agenda papier, qui se remplissait au fil des appels téléphoniques. Désormais, les agendas doivent être partagés autant avec les patients (qui peuvent prendre rendez-vous directement en ligne) qu’avec vos collègues exerçant au sein du même cabinet … La transformation digitale et la numérisation de la santé sont passés par là. Vous n’y échapperez donc pas. Il vous faut choisir un logiciel médical pour gérer votre cabinet. Mais comment le choisir au vu du nombre de solutions existantes et disponibles sur le marché ? Quels sont les critères à privilégier ? Comment estimer le coût d’un tel logiciel de gestion de cabinet médical ? Vous pouvez être un médecin à l’aise avec son époque, sans pour autant être un Geek à l’affut de toutes les innovations. Comptasanté, expert-comptable exclusivement spécialisé dans l’accompagnement des professions de santé, vous aide à faire votre choix. Alors, accrochez-vous, c’est parti …

Pourquoi choisir un logiciel médical pour votre cabinet ?

Vous vous sentez submergés au quotidien, et vous n’êtes pas le seul dans ce cas. Le logiciel de gestion vous garantit, en premier lieu, de gagner du temps en vous permettant d’automatiser des tâches récurrentes et souvent chronophages. De la gestion des données patients à la télétransmission de vos feuilles de soins, ces fonctionnalités diffèrent d’un éditeur à l’autre.

D’un autre côté, l’utilisation d’une telle solution médicale vous assure de gagner en efficacité. La gestion de l’agenda et de vos rendez-vous se fait en quelques clics, les données médicales des patientes et des patients peuvent être enregistrés en un clic et être déplacés d’un dossier à un autre,, vous disposez d’une messagerie de santé pour échanger en toute sécurité, …

Enfin, vous choisissez la voie la plus adaptée pour sécuriser les données recueillies. Les dossiers médicaux contiennent à la fois des données personnelles mais aussi des données qualifiées de confidentielles (données de santé). Il est de votre responsabilité d’en sécuriser l’accès et la conservation. Les logiciels médicaux, disponibles sur le marché, répondent aux normes de sécurisation requise.

Les logiciels pour les cabinets médicaux vous permettent donc de gagner du temps, gagner en efficacité et en sécurité (Data et conservation des données). Alors, quelles sont les fonctionnalités qui vont vous simplifier le quotidien ?

Quels logiciels pour quels professionnels ? La recherche de fonctionnalités de chaque solution disponible

La recherche d’une solution efficace doit toujours répondre à vos propres besoins. Commencez par les lister en identifiant les éventuelles spécificités de votre spécialisation. Les médecins peuvent ainsi ressentir des attentes différentes des infirmières libérales.

En règle générale, chaque produit proposé par un éditeur propose les fonctionnalités suivantes. Il vous faudra ensuite consulter les détails de tous les logiciels afin de privilégier ceux répondant le mieux à vos priorités.

• La gestion du dossier patient : Ce dossier patient regroupe toutes les informations nécessaires (renseignement administratif, antécédents médicaux, traitements de fond, allergies connues, …). Pour certains professionnels, il faudra vérifier de la possibilité d’enregistrer des résultats complémentaires comme les analyses biologiques ou encore les imageries, …
• La télétransmission des feuilles de soins électroniques
• L’agenda pour le cabinet : il faudra vérifier si cet agenda peut être partagé (avec d’autres professionnels), la capacité à une mise à jour en temps réel, si la prise de rendez-vous en ligne par les patients reste pratique, simple et rapide, … Vous pouvez aussi visualiser les informations concernant les solutions de planification de votre charge de travail, supportées par certains logiciels,
• La messagerie sécurisée de santé vous permettant notamment l’échange et le partage de données dans le respect des règles édictées par les autorités
• La connectivité avec les téléservices de l’Assurance Maladie à commencer par mon Dossier Santé,
• Une offre de LAP (Logiciel d’aide à la prescription) : rédaction des ordonnances, posologies, contre-indications, …
• La gestion de la facturation et de la comptabilité
• …

Pour les cabinets, ce choix d’un logiciel peut donc grandement améliorer la gestion au quotidien sur tous les aspects, que vous devez prendre en compte en tant que professionnels de santé.

Le tarif pour les cabinets : un critère essentiel ou un aspect à prendre en compte ?

Le tarif d’une telle solution médicale – et même chaque version d’un même logiciel peut être proposé à des tarifs différents – reste un critère de décision, mais il ne doit pas être le seul ni même le principal. N’oubliez pas en effet votre objectif premier : gagner du temps, gagner en efficacité et garantir la sécurisation de l’aspect Data.

Aussi, il vous faudra avant tout vérifier si l’interface de la solution retenue est pratique et intuitive pour faciliter votre prise en main (et celle de tous les utilisateurs). La fiche descriptive de chaque produit doit vous informer mais vous pouvez également consulter et / ou plébisciter les avis de confrères et consœurs.

Pour répondre à cet aspect pratique et facile d’utilisation, la majorité des éditeurs vous propose une démo de leur logiciel voire une période d’essai gratuite, vous permettant de vous familiariser avec l’interface.

Enfin, interrogez-vous également sur le suivi et l’accompagnement proposé ? Quelles sont les règles en cas de panne ou d’incidents ? Quel est le délai d’intervention et quelles sont les solutions proposées ?

Le tarif représente l’ensemble de ces options, qui ne doivent surtout pas être négligées puisqu’elles sont censées garantir la praticité de cette solution dans le temps.

En pratique, comment choisir en toute sérénité ?

Vous avez toutes les informations nécessaires, et pourtant vous ressentez toujours des difficultés devant l’offre pléthorique existante : AxiSanté, Doctolib,  Crossway, Medistory, Weda, Hyper med, topaze, Albus…

Dans la mesure où ces logiciels respectent les préconisations et les règles de certification de la HAS (Haute Autorité de Santé), il faut donc vous appuyer sur vos propres attentes et besoins. Si vous travaillez dans une maison de santé, et qu’une secrétaire médicale gère votre agenda, cette fonctionnalité ne sera peut-être pas la priorité dans votre sélection.

Il vous faudra donc étudier les détails de chaque fiche descriptive et de toutes les informations reçues, en vous assurant également de deux points essentiels :

• La version sélectionnée doit être compatible avec votre propre installation (Windows, Linux, …)
• L’interface doit pouvoir être utilisé sur tous vos terminaux (ordinateurs, smartphones, tablettes, …)

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