Micro-entreprise et profession libérale de santé

Simple à créer, souple à gérer, mais pas sans pièges. On vous dit vraiment ce qu'il faut savoir avant de vous lancer.

Micro-entreprise et profession libérale de santé : ce qu'il faut vraiment savoir

La micro-entreprise, c'est quoi exactement ?

La micro-entreprise est un régime fiscal et social simplifié, accessible aux travailleurs indépendants dont le chiffre d'affaires annuel reste sous un certain plafond. Anciennement appelé régime auto-entrepreneur, il a été intégré au régime de droit commun des entreprises individuelles en 2016 — mais ses avantages de simplicité ont été conservés.

En pratique, la micro-entreprise permet de :
  • Créer son activité en quelques clics sur guichet-entreprises.gouv.fr, sans capital minimum

  • Calculer ses cotisations sociales en pourcentage fixe du chiffre d'affaires réellement encaissé — si vous ne travaillez pas, vous ne payez rien

  • Opter pour le versement libératoire de l'impôt sur le revenu (sous conditions de revenus du foyer)

  • Tenir une comptabilité allégée — un simple livre de recettes chronologique suffit

  • Émettre des factures et encaisser des honoraires dès le premier jour

La simplicité administrative ne signifie pas absence d'obligations. Déclarations de chiffre d'affaires mensuelles ou trimestrielles, affiliation à la CPAM en tant que PS libéral, respect du plafond annuel, cotisations minimales aux caisses de retraite… tout cela reste à suivre attentivement.

Guide

Les professionnels de santé peuvent-ils tous opter pour ce régime ?

Techniquement oui, mais avec des nuances importantes selon votre profession et votre niveau d'activité.

Médecins remplaçants

C'est la configuration la plus courante. Un médecin remplaçant qui commence son activité, qui cumule avec un poste salarié ou qui exerce de façon intermittente peut très bien démarrer en micro-entreprise. Attention cependant au plafond de CA et aux cotisations CARMF, qui s'appliquent indépendamment du régime choisi.

Kinésithérapeutes en démarrage

Même logique : la micro-entreprise peut convenir au démarrage, surtout si le kiné exerce dans une SCM qui prend en charge les coûts de structure. Dès que l'activité est bien établie, le régime réel devient généralement plus avantageux.

Infirmières libérales (IDEL) débutantes

Pour une IDEL qui se lance et dont l'activité monte progressivement, la micro-entreprise peut être une bonne solution transitoire. Mais le plafond de 77 700 € est souvent atteint assez vite pour une IDEL active, et les charges réelles (matériel, véhicule, formation) peuvent être significatives — sans possibilité de les déduire en micro.

Orthophonistes, podologues, ostéopathes

Ces professions peuvent opter pour la micro-entreprise selon leur situation. L'élément clé reste la comparaison entre l'abattement forfaitaire du régime micro et le montant réel des charges professionnelles.

Médecins remplaçants

C'est la configuration la plus courante. Un médecin remplaçant qui commence son activité, qui cumule avec un poste salarié ou qui exerce de façon intermittente peut très bien démarrer en micro-entreprise. Attention cependant au plafond de CA et aux cotisations CARMF, qui s'appliquent indépendamment du régime choisi.

Infirmières libérales (IDEL) débutantes

Pour une IDEL qui se lance et dont l'activité monte progressivement, la micro-entreprise peut être une bonne solution transitoire. Mais le plafond de 77 700 € est souvent atteint assez vite pour une IDEL active, et les charges réelles (matériel, véhicule, formation) peuvent être significatives — sans possibilité de les déduire en micro.

Kinésithérapeutes en démarrage

Même logique : la micro-entreprise peut convenir au démarrage, surtout si le kiné exerce dans une SCM qui prend en charge les coûts de structure. Dès que l'activité est bien établie, le régime réel devient généralement plus avantageux.

Orthophonistes, podologues, ostéopathes

Ces professions peuvent opter pour la micro-entreprise selon leur situation. L'élément clé reste la comparaison entre l'abattement forfaitaire du régime micro et le montant réel des charges professionnelles.

Les professions de santé réglementées ont des obligations de cotisation auprès de caisses de retraite spécifiques (CARMF pour les médecins, CARPIMKO pour les auxiliaires…) dont les cotisations minimales s'appliquent quel que soit le régime fiscal choisi. En micro-entreprise, le montant calculé sur le CA peut être insuffisant — ce qui génère des rappels en fin d'année. C'est l'un des principaux pièges à éviter.

Avantages

Les vrais avantages pour un soignant qui se lance

Zéro barrière à l'entrée

Pas de capital à déposer, pas de statuts à rédiger, pas de greffe à saisir. La création se fait en ligne en moins d'une heure. C'est la structure la plus rapide à mettre en place pour démarrer une activité libérale — particulièrement utile pour un remplaçant ou un libéral qui teste un nouveau mode d'exercice.

Zéro barrière à l'entrée

Pas de capital à déposer, pas de statuts à rédiger, pas de greffe à saisir. La création se fait en ligne en moins d'une heure. C'est la structure la plus rapide à mettre en place pour démarrer une activité libérale — particulièrement utile pour un remplaçant ou un libéral qui teste un nouveau mode d'exercice.

Des charges proportionnelles, jamais surprenantes

Si votre chiffre d'affaires est faible un mois donné — arrêt maladie, vacances, début d'activité — vos cotisations sont proportionnellement réduites. Pas de charges fixes indépendantes de votre activité. Pour quelqu'un qui démarre, cette souplesse est précieuse pour la trésorerie.

Des charges proportionnelles, jamais surprenantes

Si votre chiffre d'affaires est faible un mois donné — arrêt maladie, vacances, début d'activité — vos cotisations sont proportionnellement réduites. Pas de charges fixes indépendantes de votre activité. Pour quelqu'un qui démarre, cette souplesse est précieuse pour la trésorerie.

Une trésorerie lisible et prévisible

Le calcul des cotisations et de l'impôt (en cas de versement libératoire) est immédiat : un pourcentage fixe appliqué à chaque encaissement. Pas de régularisation imprévisible en fin d'année. Vous savez exactement ce que chaque euro encaissé vous coûte réellement.

Une trésorerie lisible et prévisible

Le calcul des cotisations et de l'impôt (en cas de versement libératoire) est immédiat : un pourcentage fixe appliqué à chaque encaissement. Pas de régularisation imprévisible en fin d'année. Vous savez exactement ce que chaque euro encaissé vous coûte réellement.

La possibilité de cumuler avec un emploi salarié

La micro-entreprise est compatible avec une activité salariée, sous réserve de respecter les règles de votre contrat et de votre convention collective. C'est une configuration courante pour les soignants qui jonglent entre salariat hospitalier et activité libérale en parallèle.

La possibilité de cumuler avec un emploi salarié

La micro-entreprise est compatible avec une activité salariée, sous réserve de respecter les règles de votre contrat et de votre convention collective. C'est une configuration courante pour les soignants qui jonglent entre salariat hospitalier et activité libérale en parallèle.

Une sortie simple si le projet ne se concrétise pas

Si l'activité libérale ne décolle pas ou si vous changez de cap, fermer une micro-entreprise est tout aussi simple que l'ouvrir. Pas de procédure de dissolution, pas de liquidation complexe.

Une sortie simple si le projet ne se concrétise pas

Si l'activité libérale ne décolle pas ou si vous changez de cap, fermer une micro-entreprise est tout aussi simple que l'ouvrir. Pas de procédure de dissolution, pas de liquidation complexe.

Zéro barrière à l'entrée

Pas de capital à déposer, pas de statuts à rédiger, pas de greffe à saisir. La création se fait en ligne en moins d'une heure. C'est la structure la plus rapide à mettre en place pour démarrer une activité libérale — particulièrement utile pour un remplaçant ou un libéral qui teste un nouveau mode d'exercice.

Une trésorerie lisible et prévisible

Le calcul des cotisations et de l'impôt (en cas de versement libératoire) est immédiat : un pourcentage fixe appliqué à chaque encaissement. Pas de régularisation imprévisible en fin d'année. Vous savez exactement ce que chaque euro encaissé vous coûte réellement.

Une sortie simple si le projet ne se concrétise pas

Si l'activité libérale ne décolle pas ou si vous changez de cap, fermer une micro-entreprise est tout aussi simple que l'ouvrir. Pas de procédure de dissolution, pas de liquidation complexe.

Des charges proportionnelles, jamais surprenantes

Si votre chiffre d'affaires est faible un mois donné — arrêt maladie, vacances, début d'activité — vos cotisations sont proportionnellement réduites. Pas de charges fixes indépendantes de votre activité. Pour quelqu'un qui démarre, cette souplesse est précieuse pour la trésorerie.

La possibilité de cumuler avec un emploi salarié

La micro-entreprise est compatible avec une activité salariée, sous réserve de respecter les règles de votre contrat et de votre convention collective. C'est une configuration courante pour les soignants qui jonglent entre salariat hospitalier et activité libérale en parallèle.

Micro-entreprise ou régime réel BNC : comment choisir ?

Pour les professionnels libéraux de santé, la question n'est pas de savoir lequel est « meilleur » — c'est de savoir lequel est adapté à votre situation spécifique.

Critères

Micro-entreprise

Régime réel BNC

Plafond de CA

77 700 € / an (2024)

Aucun

Déduction des charges réelles

Non — abattement forfaitaire de 34 %

Oui — toutes les charges déductibles

Cotisations sociales

% fixe du CA encaissé

Sur le revenu net après charges

Cotisations caisses retraites

Cotisations minimales dues malgré tout

Cotisations sur revenu réel

Comptabilité

Livre de recettes uniquement

Comptabilité complète (2035)

Déclaration fiscale

Simplifiée + option versement libératoire

Déclaration 2035 annuelle

Idéal pour

Démarrage, faibles charges, remplacement

Activité établie, charges élevées, revenus > 30 000 €

Idéal pour

Démarrage, faibles charges, remplacement

Activité établie, charges élevées, revenus > 30 000 €

Critères

Micro-entreprise

Plafond de CA

77 700 € / an (2024)

Déduction des charges réelles

Non — abattement forfaitaire de 34 %

Cotisations sociales

% fixe du CA encaissé

Cotisations caisses retraites

Cotisations minimales dues malgré tout

Comptabilité

Livre de recettes uniquement

Déclaration fiscale

Simplifiée + option versement libératoire

Idéal pour

Démarrage, faibles charges, remplacement

Idéal pour

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Critères

Régime réel BNC

Plafond de CA

Aucun

Déduction des charges réelles

Oui — toutes les charges déductibles

Cotisations sociales

Sur le revenu net après charges

Cotisations caisses retraites

Cotisations sur revenu réel

Comptabilité

Comptabilité complète (2035)

Déclaration fiscale

Déclaration 2035 annuelle

Idéal pour

Activité établie, charges élevées, revenus > 30 000 €

Idéal pour

Activité établie, charges élevées, revenus > 30 000 €

La règle empirique : si vos charges professionnelles réelles (matériel, véhicule, formation, loyer…) dépassent 34 % de votre CA, le régime réel BNC est probablement plus avantageux. En dessous, la micro-entreprise peut se défendre. Mais cette règle ne tient pas compte des cotisations retraite — d'où l'importance d'une analyse personnalisée.

On compare les deux régimes pour votre situation

Comment créer et gérer sa micro-entreprise de soignant libéral ?

Voici les étapes clés, dans l'ordre.

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01

Déclarer votre activité sur guichet-entreprises.gouv.fr : choisissez le bon code APE correspondant à votre profession de santé. C'est ce code qui détermine vos obligations et votre rattachement aux caisses.

02

Vous affilier à l'Assurance Maladie en tant que professionnel de santé libéral conventionné : démarche obligatoire, distincte de votre simple déclaration de micro-entreprise.

03

Vous inscrire auprès de votre caisse de retraite professionnelle (CARMF pour les médecins, CARPIMKO pour les infirmiers, kinés, orthophonistes, CARCDSF pour les dentistes…). Cette inscription est obligatoire et indépendante de votre régime fiscal.

04

Ouvrir un compte bancaire dédié à votre activité professionnelle : obligatoire au-delà de 10 000 € de CA sur 2 années consécutives, fortement conseillé dès le premier jour pour simplifier la comptabilité.

05

Mettre en place votre livre de recettes : document chronologique de toutes vos encaissements, à tenir à jour et à conserver 10 ans.

06

Déclarer votre CA en ligne sur autoentrepreneur.urssaf.fr — mensuel ou trimestriel selon votre option — même si votre CA est nul ce mois-là.

07

Émettre des factures conformes : numérotation séquentielle, mentions légales obligatoires (n° SIRET, mention 'TVA non applicable — article 293 B du CGI' si vous n'êtes pas assujetti).

Chaque profession de santé a ses propres spécificités d'affiliation et de conventionnement avec la CPAM. Ne pas conventionner correctement peut vous priver de vos droits à remboursement pour les patients, et compliquer votre situation sociale. Un accompagnement dès la création permet d'éviter ces erreurs structurantes.

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Nos clients nous font confiance

Excellent

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libéraux accompagnés

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note moyenne clients

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spécialisés santé

"Je pensais que la micro-entreprise me suffirait pour toujours. Compta Santé m'a aidée à voir que le régime réel était bien plus avantageux pour moi dès la deuxième année. J'ai gagné plusieurs centaines d'euros par mois."

Aurélie D., infirmière libérale, Bretagne

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FAQ

Vos questions sur la micro-entreprise, nos réponses

Faut-il un comptable en micro-entreprise ?

Est-ce qu'un médecin remplaçant a intérêt à rester en micro-entreprise ?

La TVA s'applique-t-elle en micro-entreprise ?

Qu'est-ce que le versement libératoire de l'impôt ?

Peut-on passer de la micro-entreprise au régime réel quand on veut ?

Un infirmier libéral peut-il rester en micro-entreprise longtemps ?

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